Идентификация персонального микробиома с помощью метагеномных кодов
Identifying personal microbiomes using metagenomic codes. Eric A. Franzosa, Katherine Huang, James F. Meadow, Dirk Gevers, Katherine P. Lemon, Brendan J. M. Bohannan, Curtis Huttenhower. PNAS. 2015. Vol. 112. No 22. E2930–E2938.
Число бактерий, обитающих в организме, примерно в 10 раз превышает число клеток человека. Недавние исследования сообщества микроорганизмов, обитающих на поверхности и внутри человеческого тела, выявили отчетливо проявленную индивидуализацию персонального микробиома. Причем эта индивидуализация настолько устойчива с течением времени, что позволяет говорить об уникальном «микробном отпечатке пальцев» или «биологическом паспорте», по которому можно с большой долей вероятности идентифицировать любого человека. Авторы исследования в течение месяца исследовали биологические образцы 242 добровольцев. Для каждого из них были получены так называемые метагеномные коды – последовательности генома бактерий, которые чаще всего встречались в организме участников эксперимента. Затем авторы сравнили коды с последовательностями, позже выделенными из биологических образцов, а также сопоставили информацию с кодами людей, которые не принимали участие в эксперименте. Согласно результатам исследования, метагеномные коды не только являются уникальными для каждого человека, но и остаются стабильными в течение длительного времени. По мнению ученых, меньше всего изменяется кишечная микрофлора, вероятность идентификации индивидуума по которой превышает 80%. Получается, что при определенных обстоятельствах образцы кожи, слюны или кала могут помочь установить личность человека без использования какой-либо дополнительной информации. На протяжении последних десятилетий область судебной генетики базировалась на сравнении образцов ДНК человека с базой данных ДНК. Теперь же по аналогичному принципу может быть проведено сравнение между ДНК микроорганизмов, находящихся в человеческом теле.
В.В. Стрекопытов